Substrāts zaļajam jumtam nodrošina stabilus sakņošanās un attīstības apstākļus augiem ar zemām biotopu prasībām – tādiem kā sūnām, lakstaugiem, sausumu mīlošām stiebrzālēm, ziemcietēm sēklu, dzinumu, spraudeņu, veģetācijas paklājiņu veidā.
Tas arī neļauj nezālēm augt uz zaļā jumta.